Nature повідомив про зв’язки варіацій мікробіому кишечника зі здоров’ям
Міжнародне дослідження виявило 940 незалежних зв’язків між генетичними варіаціями бактерій кишківника та 69 показниками здоров’я або чинниками впливу. Аналіз охопив зразки калу 10 781 людини з шести когорт у Нідерландах і Танзанії, повідомляє Nature.
Науковці опрацювали 11 831 зразок за допомогою метагеномного секвенування та проаналізували 244 фенотипові показники й фактори впливу. До них увійшли 92 бінарні та 152 кількісні або порядкові характеристики. Кількість учасників у конкретних аналізах залежала від доступності даних і становила від 593 до 11 706.
Дослідники виявили 50,9 млн двоалельних однонуклеотидних варіацій у ключових ділянках геномів 881 виду кишкових бактерій. Для основного аналізу вони відібрали 12,8 млн поширених варіацій у 433 видах. Ці види в середньому становили 84,3% загальної чисельності мікробної спільноти в кишківнику.
Після метааналізу автори зафіксували 49 346 статистично значущих і стійких асоціацій. Вони охоплювали 39 663 генетичні варіації у 101 бактеріальному виді. Щоб уникнути хибних результатів, пов’язаних зі спорідненістю різних штамів одного виду, команда застосувала лінійну змішану модель, яка враховувала генетичну структуру бактеріальних популяцій.
Окремі варіації були пов’язані, зокрема, з показниками раціону, окружністю талії, кількістю тромбоцитів, уживанням бета-блокаторів і статтю. Дослідження встановлює статистичні зв’язки, а не доводить причинно-наслідковий вплив конкретних бактеріальних мутацій на ці характеристики.
Автори також проаналізували потенційні функціональні наслідки варіацій для бактеріальних білків. Близько 93% відібраних варіацій містилися в ділянках, що кодують білки; 17,45% належали до міссенс-варіантів, здатних змінювати амінокислотну послідовність білка. Повний каталог знайдених асоціацій дослідники зробили доступним як ресурс для перевірки результатів і формування нових наукових гіпотез.
- Останні
- Популярні
Новини по днях
5 листопада 2026
