Дослідження виявило тисячі генетичних впливів на імунні клітини

29.10.2026, 05:20 processer.media

Масштабне дослідження TenK10K показало, що поширені й рідкісні генетичні варіанти по-різному впливають на активність генів у різних типах імунних клітин. Науковці проаналізували 5,44 млн клітин периферичної крові 1 925 людей європейського походження та виявили понад 150 тис. ефектів поширених варіантів і понад 30 тис. ефектів рідкісних варіантів на експресію генів.

Як повідомляє Nature, для кожного учасника дослідження поєднали дані секвенування всього геному та одноклітинного аналізу РНК. Після контролю якості до аналізу включили 5 438 679 клітин, які розподілили на 28 типів імунних клітин. У геномах учасників ідентифікували понад 66,6 млн варіантів, з яких 80,6% були рідкісними — з частотою менш як 1%.

Для поширених варіантів дослідники встановили 154 932 зв’язки з експресією генів щонайменше в одному типі клітин. Ці зв’язки охопили 17 674 гени — 83% генів, доступних для тестування. Майже 4 600 із них раніше не були пов’язані з генетичною регуляцією у великому дослідженні крові.

Близько половини виявлених ефектів спостерігали лише в одному або кількох типах клітин, тоді як ефекти, спільні для всіх досліджених типів, траплялися вкрай рідко. Автори також виявили додаткові незалежні сигнали для 7 131 гена: такі непервинні сигнали частіше розташовувалися далі від старту транскрипції та частіше були пов’язані з ділянками-підсилювачами, а не промоторами.

Аналіз рідкісних генетичних варіантів виявив 34 376 сигналів для 10 005 генів. Для цього застосували два статистичні підходи, які дають змогу оцінювати сукупний вплив рідкісних варіантів поблизу гена. Більшість сигналів визначили методом SKAT, придатним для ситуацій, коли різні варіанти можуть як підвищувати, так і знижувати активність гена.

Дослідники також зіставили результати з даними про 60 захворювань і показників крові. Це дало понад 60 тис. статистичних збігів для більш як 5 тис. генів та вказало на можливі молекулярні механізми для майже 900 генів, пов’язаних із варіаціями людських ознак. Окремо команда виявила понад 15 тис. генетичних ефектів, які змінювалися залежно від функціонального стану клітин, а також 164 незалежні варіанти, що регулювали чисельність таких клітинних станів.

Читати повністю…